Tohum, Astroneer’da bitki yetiştirmek için kullanılan bir eşyadır. Tohum’ler doğrudan yere yerleştirilir ve kısa bir gecikmeden sonra büyümeye başlamaları için etkinleştirilir. Bitki olgunlaştığında ek Tohum elde etmek için hasat edilebilir; bu da onları bitki örtüsünü çoğaltma ve faydalı bitki malzemeleri toplama temel döngüsünün bir parçası hâline getirir.
İki geniş Tohum türü vardır: savunmacı flora Tohum’leri ve mutant saldırgan flora Tohum’leri. Savunmacı flora Tohum’leri, normal tehlikeli davranışlarını koruyan bitkiler yetiştirirken mutant Tohum’ler saldırgan florayı artık oyuncuya zarar vermeyen dekoratif sürümlere dönüştürür. Mutant kategorisi, Enredsiseo, Globum, Cataplanta, Atactus ve Escupiflor’un mutasyona uğramış sürümleri gibi birkaç saldırgan bitki türünü içerir. Savunmacı flora Tohum’leri arasında Explocoral, Raízdaga, Enredasaltos, Laticardo, Resueleza, Espilirio ve Latihoja gibi bitkiler bulunur.
Bir Tohum kullanmak için onu yere yerleştir ve dikmek üzere Use veya etkileşim tuşunu basılı tut. Kısa bir süre sonra olgun bir bitkiye dönüşür; ardından kazılıp çıkarılabilir veya hasat edilebilir. Pratikte hasat yöntemi bitki türüne bağlıdır: savunmacı bitkiler ve Raízdaga köklerinden kazılarak çıkarılmalıdır, mutant ve zararsız bitkiler ise yalnızca onlarla etkileşime girilerek toplanabilir. Toplamayı otomatikleştirmek için Proximity Repeater da kullanılabilir. Mutant olmayan bitkiler hasat edildiğinde genellikle 1–2 Tohum düşürürken mutant bitkiler her zaman 2 Tohum düşürür ve mutant Balloons 2–3 düşürebilir.
Yere bırakılan tohumlar ekilmez veya depolanmazsa bir süre sonra kaybolur, bu yüzden hızlıca kullanılmalı ya da toplanmalıdır. Bu da onları sabit bir yerde duran eşya olmaktan çok, yenilenebilir ama geçici bir kaynak hâline getirir.
