Story: Talgeschichte, Herzen & Feste
Eine Geschichte in Stardew Valley wird oft eher durch Dialoge, Zwischensequenzen, Feste, Briefe und Details in der Umgebung erzählt als durch eine einzige Hauptquestreihe. Ein großer Teil der Hintergrundgeschichte des Spiels stammt aus dem, was die Dorfbewohner über das Tal, seine Geschichte und die Menschen sagen, die damit verbunden sind.
Legenden des Tals und örtliche Folklore

Beim Feast of the Winter Star enthält das Spiel Feiertagstraditionen und charakterbezogene Reaktionen. 
Freundschaftsgeschichten und Herzereignisse
Handlungsstränge der Dorfbewohner werden durch Freundschaft freigeschaltet. Wenn man bei einem Dorfbewohner Herzen gewinnt, werden einzigartige Ereignisse freigeschaltet, und einige dieser Ereignisse kann man dauerhaft verpassen, während andere später oder in anderer Reihenfolge angesehen werden können. Bestimmte Herzereignisse erlauben Dialogentscheidungen, die die Freundschaft beeinflussen, und manche Ereignisse verhindern Änderungen an der Freundschaft vollständig.
Einige Meilensteine in Beziehungen lösen besondere Gruppenszenen aus. Wenn der Spieler unverheiratet ist, allen verfügbaren Junggesellen oder Junggesellinnen bouquets gegeben hat, bei jedem von ihnen 10 Herzen erreicht hat und jedes ihrer 10-Herz-Ereignisse gesehen hat, löst das Betreten des entsprechenden Ortes das Gruppen-10-Herz-Ereignis aus. Bei den Junggesellinnen geschieht dies in Haley/
Ehe, Dating und saisonale Dialoge
Heiratskandidaten und Ehepartner haben zusätzliche Story-Dialoge, die mit Festen, Filmen und dem Alltag verbunden sind. Nach der Ehe kann der Spieler beim Flower Dance weiterhin mit anderen Partnern tanzen, und der Ehepartner kann ebenfalls mit jemand anderem tanzen.
Einige Dialoge nach der Heirat unterstreichen die Persönlichkeit und Überzeugungen der jeweiligen Figur. 
Yoba und Glaube im Tal
Yoba erscheint in ganz Stardew Valley als kultureller und religiöser Bezug in Dialogen. Figuren erwähnen Yoba in Segenswünschen, Ausrufen und emotionalen Momenten. Shanes Ablehnung religiöser Sprache, 
Feste, Zwischensequenzen und Charakterszenen
Mehrere Geschichten werden durch Festszenen und besondere Dialoge erzählt. Wenn man vor dem Flower Dance mit Haley spricht, sagt sie, dass sie „ihre Tanzschritte übt“, obwohl ihr Sprite nur umherwandert. Im Movie Theater können Figuren stark auf Filme reagieren, die sie nicht mögen, und Emily hat eine bestimmte Reaktion auf einen unangenehmen Film.
Der Night Market enthält außerdem eine Mermaid Boat-Szene, in der eine Meerjungfrau erscheint und für den Spieler singt. An Regentagen kann eine Meerjungfrau auf dem großen Felsen am Ufer der Pirate Cove auf Ginger Island erscheinen. Zwei Meermenschen erscheinen außerdem in der Perfektions-Zwischensequenz, und der Zauberer verweist während des Luau auf ihre Existenz.
Inseln, Orte und größerer Schauplatz
Die Welt von Stardew Valley reicht über Pelikan hinaus bis in den Gem Sea-Archipel. Ginger Island ist die einzige Insel, die der Spieler dort besuchen kann, auch wenn vom Boot aus andere Inseln zu sehen sind. Man erreicht sie, indem man Willys Boot im Hinterzimmer von Willy’s Anglerbedarf repariert und Tickets kauft. Ginger Island wird außerdem als die größte Insel des Archipels beschrieben.
Der Schauplatz ist mit weiter gefassten regionalen Bezügen wie Grampleton verbunden, das in Dialogen, Ereigniszeilen, Filmverweisen und Festkommentaren auftaucht. Diese Verweise tragen dazu bei, dass sich das Tal mit einer größeren Welt außerhalb der Farm verbunden anfühlt.
Jojas Rolle in der Geschichte der Stadt
Die Wahl einer Joja-Markt-Mitgliedschaft verändert die Wiederaufbau-Handlung der Stadt. Das Community Center wird durch das Joja Warehouse ersetzt, und Stadterneuerungen werden über das Joja Community Development Form bei Joja-Markt abgeschlossen, statt durch das Abschließen von bundles. Jede bereits abgeschlossene Wiederherstellung bleibt bestehen, während für unfertige Projekte weiterhin der volle Preis gezahlt werden muss. Auch die Abschluss-Zwischensequenzen ändern sich und zeigen Joja-Markt-Arbeiter statt der Junimos.
Kleine Hintergrunddetails und Trivia
Das Erzählen von Geschichten in Stardew Valley zeigt sich auch in kleinen Details und optionalen Dialogen. 
Sogar unabhängige kosmetische Details können den Ton der Welt verstärken. Manche Szenen, wie die Perfektions-Zwischensequenz, tragen zu dem Gefühl bei, dass das Tal voller verborgener Geschichte und seltsamer Wesen ist.